O campus da Faculdades EST dispõe de duas capelas. A capela principal está localizada no 2º piso do Prédio S e é destinada a cultos e celebrações institucionais.

A outra capela,  Bet Tefila, está  localizada ao lado do prédio E e é destinada a encontros com pequenos grupos e orações individuais. O espaço está aberto por 24 horas.